流行性乙型腦炎患者出現驚厥，多為病情嚴重的表現，常見的原因為高熱、腦實質炎症或腦水腫所致，治療可採用對症治療。
如為高熱所致者，主要以降溫為主，包括物理降溫、藥物降溫以及亞冬眠療法，物理降溫可使用冰敷額部、枕部和體表大血管部位，降溫不宜過快過猛，禁用冰水擦浴，以免引起寒戰和虛脫。
如因腦水腫所致，應加強脫水治療，可使用20%的甘露醇靜脈滴注或靜推，必要時可加用高滲糖、腎上腺皮質激素靜脈注射。
如因腦實質病變引起的，可使用鎮靜劑，常用的鎮靜劑有地西泮，也可用水合氯醛鼻飼或灌腸，也可採用亞冬眠療法，巴比妥鈉可用於預防抽搐。
