肽鏈與蛋白質在組成結構、空間形態、功能特性、理化性質、生物活性方面存在差異。
1. 組成結構：肽鏈是由多個氨基酸通過肽鍵連接而成的線性結構，僅涉及氨基酸的排列順序；蛋白質則是由一條或多條肽鏈經過複雜的折疊、盤繞等過程形成，包含一級、二級、三級甚至四級結構。
2. 空間形態：肽鏈通常呈較為伸展的線性狀態；蛋白質具有特定的三維空間結構，如球狀、纖維狀等，這是肽鏈經過折疊和修飾後形成的複雜形態。
3. 功能特性：肽鏈一般功能相對單一，多作為蛋白質合成的中間產物；蛋白質功能多樣，可作為酶催化化學反應、作為抗體參與免疫反應、作為載體運輸物質等。
4. 理化性質：肽鏈的溶解性、穩定性等理化性質相對簡單；蛋白質由於結構複雜，其理化性質受多種因素影響，如溫度、pH值等，不同蛋白質的理化性質差異較大。
5. 生物活性：肽鏈生物活性較弱或不具備明顯生物活性；蛋白質具有高度生物活性，能精准地參與生物體的各種生理過程，對生命活動至關重要。
在日常研究或應用中，對於肽鏈和蛋白質的處理需謹慎。操作時要注意控制環境條件，如溫度、酸鹼度等，避免影響其結構和功能。保存時要依據其特性選擇合適的方式，防止變質或失活。若用於實驗或治療，必須嚴格遵循相關規範和醫囑，確保安全有效。
