肛瘻恢復期一般在1個月到3個月左右。低位單純性肛瘻恢復相對較快，可能1個月左右就能恢復；而高位複雜性肛瘻恢復時間較長，通常需要3個月左右。
肛瘻恢復時間存在差異是因為不同類型肛瘻的複雜程度不同。低位單純性肛瘻瘻管位置低且簡單，涉及的組織範圍小，手術創面相對較小，術後創口愈合相對容易，所以恢復時間短。高位複雜性肛瘻瘻管位置深且走行複雜，可能涉及多個括約肌間隙，手術難度大，創面大且深，術後愈合過程中需要新生的組織多，愈合速度慢，因此恢復時間長。
在肛瘻恢復期間，創口的愈合是一個漸進的過程。術後初期，創口會有滲出、疼痛等情況，隨著時間推移，滲出逐漸減少，肉芽組織開始生長填充創口。在此期間，換藥十分關鍵，通過定期換藥可以保持創口清潔，防止感染，促進創口從基底部逐漸愈合。同時，身體的營養狀況也會影響恢復速度，營養充足能為創口愈合提供所需的物質基礎，加快愈合進程。
肛瘻恢復期間要多休息，避免劇烈運動，防止創口裂開。飲食上多吃富含膳食纖維的食物，保持大便通暢，防止便秘或腹瀉對創口造成刺激。還要按照醫生要求定期復查和換藥，以便及時發現並處理恢復過程中出現的問題，確保恢復順利。
