肛竇炎症狀緩解後，一般需要 2 周到 2 個月左右能痊癒。
肛竇炎痊癒時間存在差異，因為病情嚴重程度不同。輕度肛竇炎，炎症局限且未引發併發症，身體自身修復能力能較快發揮作用，在積極治療和良好護理下，痊癒時間相對較短。而重度肛竇炎，炎症擴散，可能引發肛周膿腫等併發症，治療難度增加，痊癒所需時間就會延長。同時，治療方法和患者自身身體狀況也會影響痊癒進程。
對於輕度肛竇炎患者，若能及時調整飲食，避免辛辣刺激食物，保持大便通暢，並配合坐浴、栓劑等保守治療，2 周左右身體可逐漸恢復正常。但如果是重度肛竇炎，除了常規治療外，可能還需手術干預，術後恢復過程相對複雜，需要 1 到 2 個月才能痊癒。而且，患者自身免疫力強，新陳代謝快，痊癒速度也會加快；反之，若患者本身體質較弱，患有慢性疾病，痊癒時間則會相應延長。
在恢復期間，患者要注意保持肛門清潔，勤換內褲，排便後可用溫水清洗肛門。飲食上多吃富含膳食纖維的食物，促進腸道蠕動，防止便秘。同時，要遵循醫生的囑咐，按時用藥、復查，以便及時瞭解恢復情況，確保肛竇炎能徹底治癒。
