一般情況下，新鮮金針菇生吃可能會中毒，而經過加工處理的乾制金針菇生吃通常不會中毒。
新鮮金針菇中含有秋水仙鹼，進入人體後會被氧化成二秋水仙鹼，這種物質對人體有較強毒性，會刺激胃腸道和泌尿系統等，引發惡心、嘔吐、腹痛、腹瀉等症狀。而乾制金針菇在加工過程中，秋水仙鹼已被去除或大量減少，所以相對安全。
除了金針菇，還有一些菌類也不宜生吃。比如野生蘑菇，很多野生蘑菇含有劇毒，即便外觀與可食用蘑菇相似，也可能隱藏致命風險。一些常見的人工栽培蘑菇，如香菇、平菇等，雖然大多烹飪後食用，但偶爾少量生吃也不一定會出現嚴重問題，不過從健康角度考慮，烹飪後食用更保險。
在日常生活中，對於菌類食物要保持謹慎態度。無論是購買新鮮菌類還是乾制菌類，都要選擇正規渠道。食用新鮮金針菇時，務必充分煮熟，以破壞其中可能存在的有害物質。不確定的菌類不要自行採摘食用，若食用菌類後出現不適症狀，應及時就醫。
