甲硝唑和奧硝唑在成分、抗菌譜、不良反應、藥代動力學、適用人群等方面存在區別。
1. 成分：甲硝唑主要成分是甲硝唑，奧硝唑主要成分是奧硝唑，二者化學結構有差異，奧硝唑是甲硝唑的第三代產品，在甲硝唑結構基礎上進行了改進 。
2. 抗菌譜：甲硝唑對大多數厭氧菌具有強大抗菌作用，如脆弱擬桿菌等。奧硝唑抗菌譜與甲硝唑相似，但對某些厭氧菌抗菌活性更強，抗菌範圍更廣，對幽門螺桿菌作用也較好 。
3. 不良反應：甲硝唑常見不良反應有惡心、嘔吐、食慾不振等胃腸道反應，還可能有神經系統症狀如頭痛、眩暈等。奧硝唑不良反應相對較少且較輕，胃腸道反應發生率低於甲硝唑，對中樞神經系統影響也較小 。
4. 藥代動力學：甲硝唑半衰期較短，一般需多次給藥；奧硝唑半衰期較長，藥效維持時間更久，給藥次數相對較少，使用更方便 。
5. 適用人群：甲硝唑適用人群廣泛，但孕婦及哺乳期女性禁用。奧硝唑在孕婦及哺乳期女性中使用相對更謹慎，權衡利弊後在醫生指導下可使用，兒童使用安全性和有效性也有相關研究支持 。
在日常生活中，使用甲硝唑或奧硝唑時，都應嚴格按照醫生的處方用藥，不能自行增減劑量或停藥。用藥期間要留意自身症狀變化，若出現嚴重不良反應或症狀未改善，需及時就醫。同時，用藥期間避免飲酒，以免引發不良反應。
