三個月寶寶消化不良拉肚子可能是餵養不當、腹部著涼、腸道菌群失調、乳糖不耐受、感染等因素，需要針對病因治療，可採取的方法有調整餵養方式、加強腹部保暖、補充益生菌、調整飲食、使用藥物治療等。
1.餵養不當：餵奶量過多或過少、餵奶時間不規律等都可能導致寶寶消化不良拉肚子。應注意按需餵養，避免過度餵養或飢餓。遵醫囑用藥，如雙歧桿菌三聯活菌散、蒙脫石散、醒脾養兒顆粒。
2.腹部著涼：寶寶腹部受涼後，胃腸功能會受到影響，出現消化不良拉肚子的情況。要注意給寶寶腹部保暖，可使用熱水袋或暖寶寶，但要注意溫度，避免燙傷。
3.腸道菌群失調：寶寶腸道菌群尚未完全建立，容易出現菌群失調，導致消化不良拉肚子。可遵醫囑補充益生菌，如枯草桿菌二聯活菌顆粒、布拉氏酵母菌散、地衣芽孢桿菌活菌膠囊。
4.乳糖不耐受：部分寶寶體內乳糖酶缺乏，無法完全消化乳糖，會出現消化不良拉肚子。可在醫生指導下調整飲食，如使用無乳糖奶粉。
5.感染：病毒、細菌等感染也會引起寶寶消化不良拉肚子。如為病毒感染，一般具有自限性；如為細菌感染，需遵醫囑使用抗生素治療，如頭孢克洛乾混懸劑、阿莫西林克拉維酸鉀乾混懸劑、阿奇霉素乾混懸劑等。
寶寶消化不良拉肚子時，家長要注意觀察寶寶的精神狀態、體溫、大便次數和性狀等。如果寶寶症狀加重或持續不緩解，應及時就醫，以免延誤病情。同時，要注意保持寶寶臀部清潔乾燥，防止紅臀的發生。
