長時間低頭後頸椎疼可能是頸部肌肉勞損、頸椎間盤退變、頸椎小關節紊亂、頸椎生理曲度改變、頸部外傷等因素，需要針對病因治療，可採取的方法有休息、物理治療、藥物治療、運動療法、手術治療等。
1.頸部肌肉勞損：長時間低頭會使頸部肌肉持續緊張，導致肌肉勞損。可通過休息、熱敷、按摩等緩解症狀。遵醫囑用藥，如布洛芬緩釋膠囊、氯唑沙宗片、活血止痛膠囊。
2.頸椎間盤退變：隨著年齡增長或長期不良姿勢，頸椎間盤可能發生退變。治療方法包括休息、牽引、物理治療等。必要時遵醫囑用藥，如甲鈷胺片、頸復康顆粒、雙氯芬酸鈉腸溶片。
3.頸椎小關節紊亂：長時間低頭可能引起頸椎小關節紊亂，出現疼痛。可通過手法復位、針灸等治療。
4.頸椎生理曲度改變：長期低頭會使頸椎生理曲度變直或反弓，引發疼痛。可通過調整坐姿、使用頸椎枕等改善。
5.頸部外傷：如突然的扭傷等，也會導致頸椎疼痛。需根據損傷情況進行治療，如冷敷、固定等。嚴重時遵醫囑用藥，如跌打丸、傷科接骨片、雲南白藥膠囊。
在日常生活中，應注意保持正確的坐姿和站姿，避免長時間低頭。定期進行頸部伸展運動，緩解頸部肌肉緊張。如頸椎疼痛症狀持續不緩解或加重，應及時就醫，遵循醫生的建議進行治療。
