陰莖裡面隱隱作痛可能是尿道炎、前列腺炎、尿道結石、陰莖損傷、性活動過度等因素，需要針對病因治療，可採取的方法有藥物治療、物理治療、手術治療等。
1. 尿道炎：尿道炎是陰莖隱痛的常見原因之一。多由細菌感染引起，可出現尿道刺痛、尿頻、尿急等症狀。治療上可遵醫囑使用抗生素，如左氧氟沙星片、頭孢克肟膠囊、阿奇霉素分散片等。同時，應注意多飲水，以沖洗尿道。
2. 前列腺炎：前列腺炎也可能導致陰莖內部隱痛，還可能伴有尿頻、尿急、尿痛、會陰部墜脹等不適。可在醫生指導下使用藥物治療，如前列舒通膠囊、鹽酸坦索羅辛緩釋膠囊、塞來昔布膠囊等。溫水坐浴等物理治療也有助於緩解症狀。
3. 尿道結石：當尿道內有結石時，可引起陰莖疼痛，疼痛可在排尿時加重，有時還可能出現血尿。較小的結石可通過多飲水、多運動等方式促進排出。較大的結石則可能需要手術治療。
4. 陰莖損傷：陰莖受到外力撞擊或過度牽拉等損傷時，也會出現隱痛。如果損傷較輕，可通過休息、冷敷等方式緩解。若損傷較重，應及時就醫，可能需要進行手術修復。
5. 性活動過度：頻繁的性活動或性行為過於劇烈，可能導致陰莖疲勞和損傷，引起隱痛。這種情況下，應適當休息，避免過度性行為，症狀通常會逐漸緩解。
在日常生活中，應注意保持個人衛生，避免不潔性行為。如果陰莖隱痛症狀持續不緩解或加重，應及時就醫，進行相關檢查，以明確病因，並在醫生的指導下進行治療。
