三歲寶寶晚上睡覺磨牙，可能是由多種原因引起的，如腸道寄生蟲感染、精神因素、牙齒咬合問題、晚餐過飽、缺乏維生素D等。
1. 腸道寄生蟲感染：寶寶腸道內有寄生蟲時，寄生蟲產生的毒素及代謝產物會刺激神經，引起磨牙。可進行驅蟲治療，如使用阿苯達唑等藥物，需在醫生指導下用藥。
2. 精神因素：寶寶白天玩耍過於興奮或緊張，晚上睡覺時大腦仍處於興奮狀態，可能會導致磨牙。家長應注意調節寶寶的情緒，避免其過度興奮或緊張。
3. 牙齒咬合問題：寶寶牙齒咬合不齊，會促使咀嚼肌不斷收縮，從而引起磨牙。可通過矯正牙齒來解決。
4. 晚餐過飽：寶寶晚餐吃得過飽，胃腸道在夜間仍在工作，引起面部咀嚼肌自發性的收縮，產生磨牙。應注意調整寶寶的飲食習慣，避免晚餐過飽。
5. 缺乏維生素D：維生素D缺乏會影響鈣的吸收，導致神經興奮性增高，引起磨牙。可適當補充維生素D和鈣劑，多曬太陽。
寶寶磨牙的原因較為複雜，如果磨牙情況較為嚴重或持續時間較長，建議及時就醫，查明原因並進行相應的治療。在日常生活中，家長要注意培養寶寶良好的生活習慣和飲食習慣，保證寶寶的健康成長。
