新生兒消化不良可能是胃腸功能發育不完善、餵養不當、腹部著涼、腸道菌群失調、腸道感染等因素導致，需要針對病因治療，可採取的方法有調整餵養方式、注意腹部保暖、補充益生菌、抗感染等。
1. 胃腸功能發育不完善：新生兒胃腸功能尚未發育成熟，消化酶分泌不足，對食物的消化能力有限。可通過少量多次餵奶，減輕胃腸負擔。餵奶後適當竪抱、拍嗝，幫助排出胃內氣體。若消化不良症狀明顯，可遵醫囑使用雙歧桿菌四聯活菌片、枯草桿菌二聯活菌顆粒、布拉氏酵母菌散調節腸道菌群，促進消化。
2. 餵養不當：餵奶量過多、餵奶頻率過快、奶粉衝泡過濃等都可能導致消化不良。要合理控制餵奶量和頻率，按照奶粉說明書正確衝泡奶粉。母乳餵養的媽媽要注意自身飲食，避免食用辛辣、油膩、刺激性食物。
3. 腹部著涼：新生兒腹部保暖不當，易引起胃腸道蠕動加快，導致消化不良。要注意新生兒腹部保暖，可使用肚兜或穿合適的衣物。也可用溫熱的毛巾熱敷腹部，但要注意溫度，避免燙傷。
4. 腸道菌群失調：使用抗生素等原因可能破壞腸道正常菌群平衡。可遵醫囑補充益生菌來調節，如酪酸梭菌活菌散、地衣芽孢桿菌活菌膠囊、雙歧桿菌三聯活菌腸溶膠囊。同時注意保持環境清潔，避免濫用抗生素。
5. 腸道感染：病毒、細菌等病原體感染腸道可引發消化不良。如果是細菌感染，需遵醫囑使用抗生素，如頭孢克肟顆粒、阿莫西林克拉維酸鉀乾混懸劑、阿奇霉素顆粒。病毒感染一般對症治療，注意補充水分和電解質，防止脫水。
日常要密切觀察新生兒的精神狀態、食慾、大便情況等。餵奶時要注意姿勢，避免新生兒吸入過多空氣。若消化不良症狀持續不緩解或伴有發熱、嘔吐、腹瀉加重等異常，應及時就醫。
