手足口病後期咳嗽可能由多種原因引起，如呼吸道感染未完全控制、氣道黏膜損傷、過敏反應、肺部併發症、胃腸功能紊亂等。
呼吸道感染未完全控制：手足口病後期，若呼吸道仍有殘留的病毒或細菌感染，可刺激呼吸道黏膜，導致咳嗽。可遵醫囑使用適當的抗感染藥物治療，同時注意保持呼吸道通暢，多喝溫水。
氣道黏膜損傷：手足口病病毒可損傷氣道黏膜，恢復期黏膜修復過程中可出現咳嗽。可使用一些具有潤喉作用的藥物，緩解咳嗽症狀，避免過度用嗓。
過敏反應：對手足口病相關的過敏原或恢復期的某些物質過敏，可能引發咳嗽。避免接觸可能的過敏原，可使用抗過敏藥物治療。
肺部併發症：少數情況下，手足口病可能累及肺部，導致肺炎等併發症，出現咳嗽。需及時就醫，進行肺部相關檢查和治療。
胃腸功能紊亂：手足口病可能影響胃腸功能，胃腸功能紊亂時可引起反射性咳嗽。注意調整飲食，避免進食過多油膩、刺激性食物，可適當使用調節胃腸功能的藥物。
注意，若咳嗽症狀持續不緩解或加重，應及時就醫，明確原因並進行針對性治療。
