腸鏡息肉的治療方法有藥物治療、內鏡下切除、高頻電凝切除、激光治療、手術治療等。
1. 藥物治療：對於較小的炎性息肉，可使用美沙拉嗪腸溶片、柳氮磺吡啶腸溶片、康復新液等藥物。美沙拉嗪腸溶片能抑制腸道炎症反應，減輕息肉部位的炎性刺激，從而控制息肉發展。柳氮磺吡啶腸溶片在腸道內分解發揮抗炎作用，對腸道黏膜的修復有幫助，可緩解息肉相關症狀。康復新液能促進受損黏膜修復，改善腸道內環境，減少息肉因炎症引發的異常增生，適用於腸道黏膜有損傷的炎性息肉情況。
2. 內鏡下切除：通過結腸鏡插入特殊器械，直接將息肉切除。對於大多數良性且較小的腸鏡息肉，這種方法能精准定位並去除病變組織。因為它在直視下操作，可清晰看到息肉位置、大小等，能完整切除息肉，避免息肉持續生長惡變，同時對腸道的損傷較小，術後恢復相對較快。
3. 高頻電凝切除：利用高頻電流產生的熱效應使息肉組織凝固、壞死、脫落。對於一些有蒂的息肉，高頻電凝能準確作用於息肉根部，使組織蛋白凝固變性，達到切除目的。由於電流作用精准，能有效止血，減少術中出血風險，對腸鏡息肉的治療效果顯著，且安全性較高。
4. 激光治療：通過激光的能量破壞息肉組織。激光的高能量可瞬間汽化或碳化息肉，對於一些不宜採用其他切除方法的較小息肉，激光能精確作用於病變部位。它能在不損傷周圍過多正常組織的情況下消除息肉，減少併發症發生，對腸鏡息肉起到有效的治療作用。
5. 手術治療：當息肉較大、懷疑惡變或內鏡下切除困難時採用。手術可直接切除包含息肉的部分腸段，能徹底去除病變組織。對於可能惡變的息肉，手術切除可防止癌細胞擴散，達到根治目的，是治療較為嚴重的腸鏡息肉的有效手段。
治療後要注意飲食調整，短期內以清淡、易消化食物為主，避免食用辛辣、油膩、刺激性食物，以防刺激腸道。保持大便通暢，避免用力排便增加腹壓影響傷口愈合。按要求定期復查腸鏡，觀察腸道恢復情況及有無息肉復發，若出現腹痛、便血等異常及時就醫。
