流行性乙型腦炎的治療方法主要有一般治療、對症治療、抗病毒治療、中醫中藥治療、康復治療等。
1. 一般治療：對於流行性乙型腦炎患者，一般治療十分關鍵。要將患者安置在安靜、涼爽且有防蚊設施的病房，密切監測體溫、呼吸、脈搏、血壓等生命體徵。給予營養豐富、易消化的流質或半流質飲食，保證患者攝入足夠的能量和營養物質，維持水電解質平衡。這樣能為患者營造良好的恢復環境，減少外界干擾，同時保障身體基本需求，有助於提高機體抵抗力，促進病情恢復。
2. 對症治療：針對流行性乙型腦炎引發的各種症狀進行對症治療。高熱時採用物理降溫與藥物降溫相結合的方式，如使用冰袋冷敷額頭、腋窩等大血管豐富處，同時可遵醫囑服用布洛芬混懸液、對乙酰氨基酚片等退熱藥物。驚厥時可選用地西泮注射液、苯巴比妥鈉注射液等藥物控制驚厥發作。呼吸衰竭時，必要時進行氣管插管或氣管切開，使用呼吸機輔助呼吸。通過對症治療能有效緩解患者不適症狀，降低併發症的發生風險。
3. 抗病毒治療：在流行性乙型腦炎治療中，抗病毒治療可抑制病毒複製。常用藥物有利巴韋林注射液，通過靜脈滴注進入體內，抑制病毒核酸合成，從而減少病毒數量。阿昔洛韋片口服後能在體內轉化為具有抗病毒活性的三磷酸阿昔洛韋，干擾病毒DNA多聚酶，阻止病毒DNA的合成。更昔洛韋膠囊可抑制病毒的DNA聚合酶，對病毒複製起到抑製作用，幫助患者減輕病毒感染症狀，促進病情好轉。
4. 中醫中藥治療：中醫中藥在流行性乙型腦炎治療中也有一定作用。可根據患者症狀、體徵等進行辨證論治。如對於暑濕蘊結證，常用清瘟敗毒飲加減，其中石膏、知母等清熱瀉火，黃連、黃芩等清熱解毒，通過中藥的綜合作用調節患者機體陰陽平衡，清除體內熱毒濕邪，改善患者症狀。還可採用針灸療法，選取大椎、曲池、合谷等穴位，通過刺激穴位調節氣血運行，增強機體免疫力，輔助治療疾病。
5. 康復治療：對於病情穩定但遺留有神經系統後遺症的流行性乙型腦炎患者，康復治療很重要。包括物理治療，如通過按摩、推拿、熱敷等促進局部血液循環，緩解肌肉緊張。運動療法，指導患者進行肢體的主動和被動運動，改善肢體功能。語言訓練，針對有語言障礙的患者進行發音、語言表達等方面的訓練。通過康復治療可最大程度改善患者的後遺症症狀，提高生活質量。
治療期間要嚴格按照醫生要求用藥，不可自行增減藥量或停藥。積極配合各項檢查，以便醫生及時瞭解病情變化調整治療方案。注意休息，避免勞累，保持良好的心態，為身體恢復創造有利條件。
