自身免疫型復發性流產可能是遺傳因素、生殖道解剖結構異常、感染因素、自身免疫異常、血栓前狀態等因素，需要針對病因治療，可採取的方法有遺傳咨詢、手術治療、抗感染治療、免疫治療、抗凝治療等。
1. 遺傳因素：夫妻雙方或胚胎染色體異常是導致復發性流產的常見原因之一。某些染色體數目或結構的改變，會使胚胎發育異常而流產。可通過遺傳咨詢，評估再次妊娠出現染色體異常的風險。必要時進行第三代試管嬰兒技術，篩選出染色體正常的胚胎進行移植，提高妊娠成功率。
2. 生殖道解剖結構異常：如子宮畸形縱隔子宮、雙角子宮等、宮頸機能不全等。子宮畸形影響胚胎著床和發育環境；宮頸機能不全易在孕中期出現宮頸內口擴張、胎膜早破而流產。子宮畸形可根據情況採取手術矯正，如縱隔子宮切除術；宮頸機能不全者，可在孕 12 - 14 周行宮頸環扎術。
3. 感染因素：生殖道感染某些病原體，如沙眼衣原體、解脲脲原體、弓形蟲等，可能引發子宮內膜炎等，干擾胚胎著床和發育。針對不同病原體選擇相應藥物，如阿奇霉素分散片、甲硝唑片、乙酰螺旋霉素片，遵醫囑用藥進行抗感染治療，治療後復查確保病原體清除。
4. 自身免疫異常：自身免疫系統錯誤攻擊胚胎組織，如抗磷脂綜合徵等。體內產生多種自身抗體，影響胎盤血液循環。可使用阿司匹林腸溶片、硫酸羥氯喹片、潑尼松片，遵醫囑用藥調節免疫，改善妊娠結局。
5. 血栓前狀態：機體凝血和纖溶系統失衡，血液處於高凝狀態，影響胎盤血供，導致胚胎缺血缺氧流產。常用低分子肝素鈉注射液、達肝素鈉注射液、華法林鈉片，遵醫囑用藥進行抗凝治療，改善胎盤微循環。
治療過程中要嚴格按照醫生要求定期復查，包括激素水平、超聲檢查等，以便及時調整治療方案。生活中保持良好作息，均衡飲食，避免劇烈運動和精神過度緊張，為再次妊娠創造良好條件。
