原發性纖毛運動障礙可能是遺傳缺陷、纖毛結構異常、纖毛功能異常、呼吸道感染、環境因素等因素，需要針對病因治療，可採取的方法有基因治療、改善纖毛結構、恢復纖毛功能、控制感染、避免不良環境等。
1. 遺傳缺陷：原發性纖毛運動障礙多由遺傳因素導致，涉及多個基因的突變，使得纖毛結構和功能出現先天性異常。基因治療是前沿方向，通過特定技術糾正突變基因。同時可使用氨溴索口服液，能促進呼吸道黏膜漿液腺分泌，減少黏液腺分泌，降低痰液黏稠度；桉檸蒎腸溶軟膠囊，可促進纖毛運動，利於痰液排出；乙酰半胱氨酸顆粒，能分解痰液中的黏性成分，遵醫囑用藥改善呼吸道狀況。
2. 纖毛結構異常：多種原因可致纖毛結構出現問題，如纖毛的微管排列紊亂等。可通過物理方法輔助改善，如胸部物理治療，包括拍背、體位引流等，促進痰液排出。藥物方面，可使用沙丁胺醇氣霧劑，擴張支氣管，利於纖毛擺動；布地奈德混懸液，減輕氣道炎症；福多司坦片，調節黏液分泌，遵醫囑使用以恢復纖毛正常功能環境。
3. 纖毛功能異常：纖毛的運動功能受多種因素影響而出現異常，導致其清除異物和病原體能力下降。可採用呼吸訓練方法，如縮唇呼吸、腹式呼吸等，增強呼吸肌力量，輔助纖毛功能。藥物上，可選用孟魯司特鈉片，減輕氣道高反應性；氨茶鹼緩釋膠囊，舒張支氣管平滑肌；異丙托溴銨氣霧劑，抑制氣道黏液分泌，遵醫囑用藥改善纖毛功能。
4. 呼吸道感染：反復的呼吸道感染會破壞纖毛，影響其正常功能。積極控制感染是關鍵，對於細菌感染，可遵醫囑使用阿莫西林克拉維酸鉀片、頭孢克肟膠囊、阿奇霉素分散片等抗生素。同時配合使用止咳祛痰藥物，如肺力咳合劑、急支糖漿、氨溴索糖漿等，減輕呼吸道症狀，促進纖毛功能恢復。
5. 環境因素：長期處於空氣污染、化學物質刺激等不良環境中，會損害纖毛。應盡量避免接觸不良環境，外出佩戴口罩。可使用空氣淨化器改善室內空氣質量。藥物上，可使用維生素C片，增強機體抗氧化能力；維生素E軟膠囊，保護細胞免受自由基損傷；玉屏風顆粒，增強機體抵抗力，遵醫囑服用以減輕環境因素對纖毛的損害。
日常生活中要注意生活規律，保證充足睡眠，適當進行有氧運動，如散步、太極拳等，增強體質。飲食上多攝入富含營養的食物，如蛋白質、維生素豐富的食物，增強機體抵抗力。定期復查，根據病情變化及時調整治療方案。
