艾滋病抗病毒治療可能是藥物不良反應、病毒耐藥、免疫重建炎症綜合徵、機會性感染、依從性差等因素，需要針對病因治療，可採取的方法有調整藥物方案、更換治療藥物、控制炎症反應、治療機會性感染、提高患者依從性等。
1. 藥物不良反應：艾滋病抗病毒藥物可能引發多種不良反應，像核苷類反轉錄酶抑制劑可能導致乳酸酸中毒、脂肪代謝異常；非核苷類反轉錄酶抑制劑易引起皮疹、肝功能損害；蛋白酶抑制劑會造成血脂異常、胃腸道不適等。出現不良反應後，需及時與醫生溝通，在醫生指導下調整藥物。比如可將齊多夫定片換為替諾福韋酯膠囊，或把依非韋倫片調整為奈韋拉平片，也可將洛匹那韋/利托那韋軟膠囊換為阿扎那韋膠囊，均需嚴格遵醫囑用藥。
2. 病毒耐藥：長期使用抗病毒藥物，病毒可能發生變異產生耐藥。耐藥後原有藥物療效降低，病毒載量反彈。通過耐藥檢測確定耐藥情況，醫生會根據結果更換藥物。例如從拉米夫定片換為恩曲他濱膠囊，從替拉那韋軟膠囊換為達蘆那韋片，從雷特格韋片換為多替拉韋鈉片，務必遵醫囑進行藥物更換。
3. 免疫重建炎症綜合徵：抗病毒治療後免疫系統逐漸恢復，可能對體內潛伏病原體產生免疫反應，引發炎症。表現為發熱、咳嗽、腹瀉等症狀。治療時需在醫生指導下使用糖皮質激素如潑尼松片、地塞米松片、甲潑尼龍片等控制炎症反應，同時繼續進行抗病毒治療，嚴格按醫囑用藥。
4. 機會性感染：艾滋病患者免疫力低下，易發生各種機會性感染，如肺孢子菌肺炎、巨細胞病毒感染、結核桿菌感染等。針對不同感染進行相應治療，如肺孢子菌肺炎使用復方磺胺甲惡唑片、氨苯碸片、克林霉素磷酸酯膠囊；巨細胞病毒感染用更昔洛韋膠囊、膦甲酸鈉注射液、纈更昔洛韋片；結核桿菌感染用異煙肼片、利福平膠囊、吡嗪酰胺片，都要嚴格遵醫囑。
5. 依從性差：患者未按時、按量服藥，會影響治療效果。可通過加強健康教育，讓患者瞭解按時服藥重要性；提供便利服藥方式，如使用藥盒；家人監督等提高依從性。
治療過程中要定期到醫院復查，包括血常規、肝腎功能、病毒載量、CD4+T淋巴細胞計數等指標，以便醫生及時瞭解治療效果和身體狀況，根據實際情況調整治療方案。日常生活中保持良好生活習慣，均衡飲食、適度運動、規律作息，避免感染。
