肛門感染可能是局部衛生不良、外傷、肛腸疾病、細菌感染、真菌感染等因素，需要針對病因治療，可採取的方法有保持清潔、處理傷口、治療原發病、使用抗菌藥物、抗真菌藥物等。
1. 局部衛生不良：日常不注意肛門清潔，糞便殘留、分泌物積聚等易滋生細菌引發感染。應每日用溫水清洗肛門，尤其是便後，保持局部清潔乾爽。可使用溫和的沐浴產品，但避免過度清潔損傷皮膚。勤換內褲，選擇棉質、透氣性好的內褲。
2. 外傷：如異物刺傷、搔抓等導致肛門皮膚破損，細菌趁機侵入引起感染。對於輕微外傷，用碘伏消毒後塗抹紅霉素軟膏、莫匹羅星軟膏、夫西地酸乳膏，遵醫囑用藥。避免再次搔抓，防止傷口惡化。若傷口較深或出現紅腫、滲液等嚴重情況，及時就醫處理。
3. 肛腸疾病：痔瘡、肛裂、肛瘻等肛腸疾病會導致局部血液循環不暢、分泌物增多，利於細菌繁殖引發感染。積極治療原發病，如痔瘡可使用馬應龍麝香痔瘡膏、肛泰軟膏、復方角菜酸酯栓，遵醫囑用藥；肛裂可採用坐浴結合藥物治療；肛瘻一般需手術治療。
4. 細菌感染：大腸桿菌、金黃色葡萄球菌等細菌感染肛門周圍組織。根據病情，可口服頭孢克肟膠囊、阿莫西林膠囊、左氧氟沙星片，遵醫囑用藥。同時注意飲食清淡，避免刺激性食物，以免加重症狀。
5. 真菌感染：白色念珠菌等真菌感染肛門，常見於免疫力低下或長期使用抗生素人群。可外用克霉唑乳膏、酮康唑乳膏、硝酸咪康唑乳膏，遵醫囑用藥。保持肛門局部乾燥，避免久坐，增強自身免疫力。
治療期間要嚴格按照醫生囑咐用藥，不可自行增減藥量或停藥。注意觀察症狀變化，若感染症狀持續不緩解甚至加重，如出現發熱、劇烈疼痛等，應及時復診。日常養成良好生活習慣，合理飲食，適度運動，有助於預防肛門感染復發 。
