甲溝炎的根治方法有藥物治療、物理治療、中醫治療、甲溝成形術、拔甲術等。
1. 藥物治療：對於甲溝炎，藥物治療是常見的基礎方法。外用藥物如莫匹羅星軟膏，它能有效抑制和殺滅多種革蘭陽性球菌，對甲溝炎常見的金黃色葡萄球菌等有很好的抗菌作用，可直接塗抹在甲溝發炎部位，減輕炎症。夫西地酸乳膏也常用於甲溝炎，其能通過抑制細菌蛋白質合成來發揮抗菌活性，促進炎症消退。口服藥物如阿莫西林膠囊，遵醫囑服用後可在體內發揮抗菌作用，從內部控制感染，防止炎症擴散，對於甲溝炎病情的緩解和根治有積極意義。
2. 物理治療：甲溝炎採用物理治療可輔助改善症狀。熱敷能促進甲溝部位的血液循環，加快炎症的吸收和消散。通過熱傳遞，使局部血管擴張，為組織帶來更多的營養物質和免疫細胞，有助於抗感染。紅外線照射也是一種物理手段，它能產生溫熱效應，增強局部組織的代謝功能，提高細胞的活力，促進炎症的愈合，對於甲溝炎引起的紅腫疼痛等症狀有一定的緩解作用，幫助病情向好發展。
3. 中醫治療：中醫在治療甲溝炎方面也有獨特之處。中藥泡腳，選用一些具有清熱解毒、活血化瘀功效的中藥，如黃柏、大黃等，將其熬製成藥水後泡腳，藥物成分可通過皮膚滲透到甲溝部位，起到消炎止痛、改善局部氣血運行的作用，從而緩解甲溝炎症狀。中藥外敷，像如意金黃散，將其用醋或水調成糊狀後敷在患處，能清熱解毒、消腫止痛，對於甲溝炎的炎症有較好的抑制效果，促進病情恢復。
4. 甲溝成形術：甲溝成形術針對甲溝炎有其獨特的治療原理。當甲溝炎反復發作，是因為甲溝的結構存在異常，導致細菌容易滋生和感染難以徹底清除。甲溝成形術通過手術的方式對甲溝進行重新塑形，改變其不利於引流和清潔的結構，使甲溝恢復正常的生理形態，減少細菌的積聚，從根本上消除甲溝炎復發的隱患，達到根治的目的。
5. 拔甲術：拔甲術是治療甲溝炎較為激進但有效的方法。當甲溝炎病情嚴重，指甲已經嚴重嵌入甲溝，導致局部炎症劇烈，藥物等保守治療難以奏效時採用。拔除指甲後，能直接去除引發炎症的重要因素，使甲溝部位充分暴露，便於進行徹底的清創和消毒，減少細菌滋生的環境，同時新的指甲在重新生長過程中，有機會形成正常的形態和結構，從而達到根治甲溝炎的效果。
治療甲溝炎期間，要保持患處清潔乾燥，避免沾水以防感染加重。盡量選擇寬松舒適的鞋子，減少對甲溝部位的擠壓。按照醫生的囑咐按時用藥、定期換藥，若出現病情變化如紅腫加劇、疼痛加重等情況，及時就醫。
