一般來說，飲用蜂蜜水較好的時間是在飯前 1.5 小時或飯後 2 小時左右。
飯前 1.5 小時飲用蜂蜜水，此時胃內基本排空，蜂蜜水可以快速被吸收進入血液，其中含有的葡萄糖、果糖等營養成分能為身體補充能量，還能調節胃酸分泌。蜂蜜中的酶類等物質有助於刺激胃酸分泌，對於胃酸分泌過少的人有一定益處。飯後 2 小時飲用，這時食物在胃內經過初步消化，適量飲用蜂蜜水可促進腸胃蠕動，幫助消化吸收，減輕腸胃負擔，讓營養物質更好地被身體利用。
蜂蜜水不僅在飲用時間上有講究，其功效也頗為豐富。它具有潤肺止咳的作用，對於肺燥引起的咳嗽，蜂蜜的滋潤特性可緩解呼吸道的乾燥，減輕咳嗽症狀。同時，蜂蜜還有一定的美容養顏功效，其富含的多種維生素和抗氧化物質，能促進皮膚新陳代謝，減少色斑形成，使皮膚更加光滑細膩。
在日常飲用蜂蜜水時，要注意水溫。不宜用過熱的水衝調蜂蜜，因為高溫會破壞蜂蜜中的營養成分，一般建議用 40℃以下的溫水衝調。而且，糖尿病患者飲用蜂蜜水需謹慎，由於蜂蜜含有一定量的糖類，過量飲用可能導致血糖升高，應在醫生指導下合理飲用。一歲以下的嬰兒不宜飲用蜂蜜水，因為蜂蜜可能含有肉毒桿菌芽孢，嬰兒腸胃功能尚未發育完全，飲用後可能引發中毒。
