一般情況下，肛瘻手術的恢復時間在20至40天。
肛瘻手術的恢復時間受多種因素影響。手術方式是重要因素之一，比如單純的肛瘻切開術，相對來說創面較小，恢復可能會快一些，通常20天左右能基本恢復；而複雜性肛瘻手術，由於創面大、涉及的組織多，恢復時間可能會達到30至40天。患者自身的身體狀況也會對恢復時間產生影響，身體素質好、免疫力強的患者，恢復速度相對較快；反之，若患者本身有基礎疾病，如糖尿病等，恢復時間可能會延長。
術後的護理情況同樣關鍵。如果患者能嚴格按照醫囑進行護理，保持創面清潔，定期換藥，避免感染等併發症的發生，恢復時間會在預期範圍內。若護理不當，出現創面感染、假性愈合等問題，不僅會增加患者的痛苦，還會使恢復時間大大延長。
術後要保持肛門局部清潔，每次排便後用溫水清洗。飲食上多吃富含膳食纖維的食物，保持大便通暢，避免便秘和腹瀉。避免久坐、久站，適當進行活動。同時，要密切關注創面恢復情況，若出現紅腫、疼痛加劇、異常分泌物等，應及時就醫。
