中醫認為扁平疣的發生與風熱毒邪侵襲、肝郁氣滯、氣血失和、脾胃虛弱、正氣不足等有關。
1.風熱毒邪侵襲：人體腠理不密，衛外不固時，風熱毒邪易乘虛而入，客於肌膚。風熱之邪蘊結於皮膚，導致氣血凝滯，經絡不暢，從而引發扁平疣。風熱毒邪常表現為發病較急，疣體初起，數目較多，顏色較紅，伴有瘙癢等症狀。
2.肝郁氣滯：情志不暢，肝氣郁結，氣郁則氣滯。氣滯不能行血，導致氣血運行不暢，瘀滯於肌膚。肝郁氣滯還可化火，灼傷陰血，使肌膚失養，更易受到外邪侵襲，從而誘發扁平疣。患者常伴有情緒抑鬱、煩躁易怒、胸脅脹滿等症狀。
3.氣血失和：氣血是維持人體生命活動的基本物質，氣血失和則會影響肌膚的正常代謝。氣血不暢，經絡阻滯，肌膚得不到充足的氣血滋養，抵抗力下降，容易被病毒感染而發生扁平疣。氣血失和的患者疣體顏色多暗淡，病程較長。
4.脾胃虛弱：脾胃為後天之本，氣血生化之源。脾胃虛弱則運化失常，水谷精微不能正常輸布，導致氣血生化不足。氣血虧虛，肌膚失養，衛外功能減弱，易受外邪侵犯，引發扁平疣。脾胃虛弱的患者常伴有食慾不振、腹脹便溏、面色萎黃等症狀。
5.正氣不足：正氣是人體抵御外邪的能力。當人體正氣不足時，衛外功能低下，不能有效地抵御外界病毒的侵襲，病毒乘虛而入，潛伏於肌膚，從而導致扁平疣的發生。正氣不足的患者一般體質較弱，容易感冒，疣體容易反復出現。
扁平疣的治療需根據個人體質和病情進行辨證論治，同時要保持心情舒暢，避免搔抓疣體，以防自身接種傳播。飲食宜清淡，適當鍛鍊，增強體質。
