六神丸一般對流感病毒感染有一定輔助治療作用，但不能單純依靠它治癒流感病毒感染。
六神丸含有麝香、蟾酥等成分，具有清熱解毒、消腫利咽、化腐止痛等功效。從中醫角度，流感病毒感染引發的發熱、咽喉腫痛等症狀，六神丸的這些特性可在一定程度上緩解不適。現代研究也發現，其部分成分可能具有抗炎、抗病毒等藥理活性，能夠調節人體免疫功能，幫助身體對抗流感病毒。
流感病毒感染是由特定流感病毒引起的急性呼吸道傳染病，治療通常需要使用專門針對流感病毒的藥物，如神經氨酸酶抑制劑等進行抗病毒治療。六神丸並不能像這些特效抗病毒藥物一樣直接抑制或殺滅流感病毒，只是在改善流感引發的一些症狀方面發揮作用。
在使用六神丸時，要注意其含有毒性成分，不可過量或長期服用。兒童、孕婦及對其中成分過敏者應慎用。如果出現流感症狀，應及時就醫，在醫生指導下規範用藥，不可自行隨意加大六神丸劑量或僅依賴它治療，以免延誤病情。
