兩性霉素B的藥物相互作用有與腎上腺皮質激素等、與洋地黃苷類等、與氟胞嘧啶等、與抗腫瘤藥物等、與神經肌肉阻滯劑等。
1. 與腎上腺皮質激素：合用可能加重低鉀血症，導致腎上腺皮質功能減退，增加患者發生心臟毒性、肝毒性等不良反應的風險。因為腎上腺皮質激素本身可引起水鈉瀦留、排鉀增多，而兩性霉素B也有一定的排鉀作用，二者疊加會使血鉀進一步降低。
2. 與洋地黃苷類：兩性霉素B可引起低鉀血症，而低鉀血症會增加機體對洋地黃苷類藥物的敏感性，容易誘發洋地黃中毒，出現心律失常等嚴重不良反應。
3. 與氟胞嘧啶：二者有協同抗菌作用，但同時也可能增加氟胞嘧啶的毒性反應，如血液系統毒性等。因為兩性霉素B可能影響氟胞嘧啶在體內的代謝過程。
4. 與抗腫瘤藥物：合用可能增加腎毒性、骨髓抑制等不良反應的發生幾率。抗腫瘤藥物本身對骨髓和腎臟就有一定的損害作用，與兩性霉素B聯用時，這種損害可能會進一步加重。
5. 與神經肌肉阻滯劑：合用時可能增強神經肌肉阻滯作用，導致呼吸抑制等嚴重後果。因為兩性霉素B可能影響神經肌肉接頭處的功能。
在使用兩性霉素B時，應告知醫生正在使用的其他藥物，以便醫生綜合評估藥物相互作用的可能性。若出現不適症狀，需及時反饋，由醫生調整治療方案。
