一般來說，肛瘻手術後2-5天最痛。
肛瘻手術後的疼痛程度和時間會因多種情況而有所不同。在術後2-5天這個階段，通常是創面開始出現炎性反應的時候，局部組織腫脹、滲出，對神經末梢的刺激較為明顯，所以疼痛相對劇烈。如果肛瘻較為複雜，手術創面大，疼痛可能會更明顯，持續時間也可能稍長一些；而對於一些簡單的肛瘻手術，疼痛程度可能相對較輕，但在這個時間段也通常是疼痛較為突出的時期。
從手術過程來看，手術中對肛門周圍組織的切割、牽拉等操作會造成一定程度的損傷，術後創面會逐漸愈合。在愈合早期，也就是2-5天，身體的炎症反應和局部張力變化會導致疼痛加劇。而且排便過程中，糞便對創面的刺激也會使疼痛進一步加重。
術後要保持肛門清潔，每次排便後可用溫水坐浴，以促進局部血液循環，緩解疼痛和腫脹。避免食用辛辣、刺激性食物，以防加重疼痛和影響創面愈合。同時，要注意休息，避免長時間站立或坐著，防止局部血液循環不暢，影響恢復。
