乳糖不耐受寶寶的症狀持續時間因人而異，一般輕度乳糖不耐受可能會持續1-2周，而嚴重的乳糖不耐受可能會持續4-8周甚至更久。若寶寶乳糖不耐受症狀嚴重，如頻繁腹瀉、體重不增、哭鬧不止等，應及時就醫，在醫生的指導下進行診治。
對於輕度乳糖不耐受的寶寶，其腸道內乳糖酶只是部分缺乏。當減少乳糖攝入或食用低乳糖奶粉後，腸道負擔減輕，殘留的乳糖酶能夠逐漸對攝入的少量乳糖進行分解消化，隨著腸道黏膜的自我修復和乳糖酶活性的一定恢復，症狀在1-2周左右可慢慢減輕直至消失。
而嚴重乳糖不耐受的寶寶，腸道乳糖酶嚴重不足甚至缺失，腸道黏膜受損較為嚴重，恢復起來較為緩慢。即使調整飲食，腸道功能和乳糖酶的重新建立也需要較長時間，可能需要4-8周，期間還可能因腸道敏感性高，再次接觸少量乳糖就會導致症狀反復，從而使症狀持續存在。
母乳餵養的媽媽應減少含乳糖食物的攝入，人工餵養的寶寶可選擇低乳糖或無乳糖配方奶粉。添加輔食時，要循序漸進，避免過早添加含乳糖高的奶製品。同時，注意寶寶腹部保暖，防止著涼加重腸道不適。
