常見治療長期拉肚子的藥物有蒙脫石散、雙歧桿菌四聯活菌片、黃連素片、復方地芬諾酯片、洛哌丁胺膠囊等。
1. 蒙脫石散：對消化道內的病毒、病菌及其產生的毒素、氣體等有極強的固定、抑製作用，使其失去致病作用；此外對消化道黏膜還具有很強的覆蓋保護能力，修復、提高黏膜屏障對攻擊因子的防禦功能，具有平衡正常菌群和局部止痛作用。常用於成人及兒童急、慢性腹瀉。
2. 雙歧桿菌四聯活菌片：可直接補充人體正常生理細菌，調整腸道菌群平衡，抑制並清除腸道中致病菌，減少腸源性毒素的產生，促進機體對營養物的消化，合成機體所需的維生素，激發機體免疫力。用於治療與腸道菌群失調相關的腹瀉、便秘、功能性消化不良等。
3. 黃連素片：對痢疾桿菌、大腸桿菌、金黃色葡萄球菌等有抑製作用，具有清熱燥濕、行氣止痛、止痢止瀉的功效。主要用於大腸濕熱，赤白下痢，里急後重或暴注下瀉，肛門灼熱；腸炎、痢疾見上述證候者。
4. 復方地芬諾酯片：可提高腸張力、抑制腸蠕動，從而達到止瀉的效果。適用於急、慢性功能性腹瀉及慢性腸炎等。
5. 洛哌丁胺膠囊：作用於腸壁的阿片受體，阻止乙酰膽鹼和前列腺素的釋放，從而抑制腸蠕動，延長腸內容物的滯留時間，增加水和電解質的吸收。用於控制急、慢性腹瀉的症狀。
長期拉肚子病因複雜，可能是多種因素引起，在用藥前應明確病因。如果用藥後症狀未緩解或者出現其他不適，應及時就醫，在專業指導下調整用藥方案。
