通常情況下，沙眼衣原體感染的治癒時間在1-3周。
沙眼衣原體感染後的恢復時間受多種因素影響。感染部位不同，恢復時間會有所差異。比如眼部沙眼衣原體感染，若症狀較輕，經過規範治療，通常1周左右症狀可明顯改善，2周左右基本痊癒；而生殖系統的沙眼衣原體感染，相對來說治療週期可能稍長一些，一般需要2-3周。患者自身的免疫力也起著關鍵作用，免疫力較強的患者恢復時間可能會相對縮短，而免疫力較弱的患者，恢復時間可能會接近甚至超過3周。
從治療方面來看，治療方法的選擇和治療的依從性也會影響恢復時間。如果能早期診斷並及時採用敏感的抗生素進行規範、足療程治療，通常能在較短時間內控制病情。但如果治療不規範，比如自行停藥或換藥，就容易導致病情反復，延長治癒時間。
日常要注意個人衛生，勤洗手、勤換洗衣物，避免不潔性行為。患病期間應避免前往人員密集場所，防止交叉感染。同時，要保證充足的休息和合理的飲食，適當鍛鍊增強免疫力，促進身體恢復。
