一般情況下，結腸鏡檢查的間隔時間為1-10年。
對於沒有腸道疾病症狀、家族史等高危因素的普通人群，通常5-10年做一次結腸鏡檢查即可。因為腸道在相對健康狀態下，短時間內發生嚴重病變的概率較低，間隔較長時間檢查能滿足篩查需求。而對於有腸道息肉、炎症性腸病等病史的患者，一般1-3年復查一次結腸鏡。因為這類人群腸道再次出現病變的風險相對較高，定期復查有助於及時發現新的病變並進行處理。對於有結腸癌家族史等高危因素的人群，可能2-5年就需要做一次結腸鏡檢查，以便早期發現潛在的病變。
隨著年齡的增長，腸道發生病變的風險也會逐漸增加。50歲以上人群即使沒有明顯症狀，也建議定期進行結腸鏡檢查。另外，生活方式不健康，如長期高脂肪、低纖維飲食，缺乏運動，吸煙酗酒等人群，腸道病變風險也會升高，可能需要適當縮短檢查間隔時間。
日常應保持健康的生活方式，多吃蔬菜、水果、全穀物等富含膳食纖維的食物，適量運動，戒煙限酒。結腸鏡檢查後可能會出現腹脹、腹痛等不適，一般會逐漸緩解，若出現劇烈腹痛、便血等異常情況，應及時就醫。
