芡實的副作用可能有過敏、上火、消化不良、便秘、血糖升高等，所以需要用藥時，應及時就醫，在醫生指導合理用藥治療，不要私自用藥。
1.過敏：若本身對芡實過敏，在接觸或食用芡實後，可能會刺激免疫系統，比較容易誘發過敏反應，從而出現局部瘙癢、紅疹等過敏症狀。
2.上火：因為芡實本身具有一定滋補效果，若長期大量食用，可能會導致機體產生火氣上升的現象，產生小便黃、口乾舌燥、咽喉疼痛等上火症狀。
3.消化不良：由於芡實內部澱粉含量較多，若短時間大量進食，可能會導致胃腸道負擔加重，從而導致食用者出現腹痛、腹脹等消化不良症狀。
4.便秘：芡實本身的質地比較硬，並且還含有較多的纖維素，過量進食後，可能會使糞便硬化，從而產生便秘的現象，此時也可能會導致患者有大便乾燥、排便困難等情況。
5.血糖升高：因為芡實中富含澱粉，澱粉經過人體消化後，會轉變成葡萄糖，如果長期大量食用芡實，可能會導致血糖水平升高。
芡實應該在乾燥容器內用鹽製品密閉保存，若發現芡實存在發霉或異味等變質現象，不建議繼續進食，如果食用芡實後，產生較為嚴重的不適症狀，需要及時告知醫生，讓醫生進行處理。
