腹痛若是暑濕感冒、腸道功能紊亂引起，藿香正氣丸通常可以治療。但如果是急性胃腸炎、闌尾炎、膽囊炎等因素造成，一般起不到治療作用。
如果腹痛是暑濕感冒引起，伴隨惡寒、發熱、嘔吐、洩瀉等現象，或者是腸道功能紊亂造成，使用藿香正氣丸可以通過其解表退熱，和中理氣的作用，去除體內濕邪熱邪，促進胃腸道蠕動，幫助減輕腹痛。
腹痛是急性胃腸炎、闌尾炎、膽囊炎等因素造成，通常需要使用抗生素控制炎症，促進身體恢復，而藿香正氣丸對上述病因造成的腹痛治療作用有限，並且不符合該藥物的適應症，通常不能治療。
為了確保身體恢復，出現腹痛後，建議患者到醫院在醫生的指導下，根據病因使用正確的藥物進行治療。同時保持飲食清淡、作息規律、心情舒暢等。
