扁桃體炎不存在如何根治的說法，可以通過物理療法、藥物療法、手術療法防止病情的不斷加重。
1.物理療法：採用冷凍療法產生的深低溫，可以破壞扁桃體局部的病變組織，而激光療法能使病變組織被迅速凝固汽化進而壞死脫落。另外微波治療等方法，對於扁桃體炎的恢復都有很大幫助。
2.藥物療法：比如阿莫西林膠囊、鹽酸左氧氟沙星片、布洛芬緩釋膠囊等西藥，能夠起到抗炎抗感染、解熱鎮痛的功效。而板藍根顆粒、蒲地藍消炎口服液、牛黃解毒丸等中成藥，能夠起到清熱解毒、消腫利咽的功效。
3.手術療法：如扁桃體炎的症狀較為嚴重，已經出現其他併發症或是多次反復發作，可以通過手術方法將扁桃體完整切除，避免加重以後出現扁桃體化膿的現象。
除以上幾種常用方法之外，低溫等離子刀切除術、超聲刀以及中醫針灸等方法，對於扁桃體炎的治療效果都很明顯。患者在治療期間要注意不能吸煙喝酒，也不能吃刺激性大的食物，否則都會導致病情加重增加治療的難度。
