甲硝唑對支原體感染基本沒有效果，具體用藥需要在醫生的指導下進行。
甲硝唑屬於一種抗生素，主要用來治療厭氧菌感染，當然對於一些寄生蟲也有一定的治療效果。而支原體是介於細菌和病毒之間的微生物，由於其表面不具備細胞壁，因此通過使用作用於細胞壁的抗生素治療效果不佳，比如青霉素和頭孢菌素等。雖然甲硝唑不是通過作用與細胞壁來進行殺菌，但是由於支原體和細菌的結構存在較大的差異性，所以針對支原體感染患者應用甲硝唑進行治療效果不佳。
發生支原體感染需要明確具體的感染部位，如果是肺部支原體感染可使用一些大環內酯類抗生素，比如紅霉素片、羅紅霉素膠囊等。如果是生殖器支原體感染可使用阿奇霉素片、鹽酸多西環素片等藥物進行治療。
平時應注意室內通風，避免進行不潔的性行為，注意改善個人飲食，適當進行運動提高免疫力，這樣可有效預防支原體感染的發生。
