出口瘡的原因較多，跟免疫因素、遺傳因素、系統性疾病、飲食不當等方面的原因都有關。由於發病原因不同，在治療方法上也有一定的差異，因此出口瘡後不能盲目治療，要先去醫院做個全面的檢查，掌握病因跟病情程度以後對症治療，這樣才能促進口瘡更快消失。
1.免疫因素
包括細胞免疫異常、體液免疫異常、自身免疫異常，這些不良因素都會導致機體的免疫力下降，因此更容易受到病原體的感染而出現口瘡。
2.遺傳因素
口瘡的發病跟遺傳有一定的關係，有研究證明大約40%左右的患者，都存在家族遺傳的口瘡病史。
3.系統性疾病
比如胃潰瘍、十二指腸潰瘍、潰瘍性結腸炎或肝膽疾病，對於口瘡的發作都有推動的作用。
4.飲食不當
經常節食挑食，會導致體內的葉酸、鋅、鐵以及維生素等營養物質攝取不均衡，對於細胞的分裂再生功能有很大的影響，因此得口瘡的幾率就會增加。
除了以上這幾個方面的原因之外，口腔黏膜創傷，或者是精神壓力大，以及經常吸煙喝酒、熬夜等不良的因素，都是導致口瘡發作的重要原因。
