目前認為，該病的發病機制是白塞病患者，在各種發病原因的作用下出現免疫功能紊亂，包括細胞免疫和體液免疫失常，抗口腔黏膜抗體出現、免疫球蛋白增高、淋巴細胞浸潤、嗜中性粒細胞功能亢進、內皮細胞損傷與血栓形成、免疫系統針對自身器官組織產生反應，導致器官組織出現炎症，產生破壞。
白塞病可侵害人體多個器官，包括口腔、皮膚、關節肌肉、眼睛、血管、心臟、肺和神經系統等，主要表現為反復口腔和會陰部潰瘍、皮疹、下肢結節紅斑、眼部虹膜炎、食管潰瘍、小腸或結腸潰瘍及關節腫痛等。需要規律的應用藥物治療，包括各種調節免疫藥物，不治療則預後不好，嚴重者危及生命。
