小兒植物神經紊亂的患者是需要盡早的進行治療的，首先就要去除誘發因素，如精神刺激過度的緊張，勞累，或者是要改變患兒的環境，減少刺激培養合理健康的飲食習慣。
還要多做一些戶外的運動，多參加體育鍛鍊，培養良好的生活習慣，一定要早睡早起，還要進行心理疏導，要陪患兒玩一些輕鬆的遊戲，聽一些輕鬆的音樂來放鬆精神，保持一個良好的情緒。
兒童醫院有兒童心理行為治療相關科室，可以至上述科室就診，除了行為學心理學治療，還可以應用藥物來進行治療了，需要在醫生指導下治療，可以應用調節植物神經的藥物，包括谷維素以及維生素b1。如果出現心慌的情況，還可以選擇小劑量的心得安，如果出現了胃腸道功能紊亂該應用多酶片來進行對症治療。
