慢性咽炎的治療首先需要病人戒除煙酒，清淡飲食，避免刺激性食物和有害氣體的刺激，糾正便秘和改善消化不良的問題。需要積極的治療各種可能的疾病，比如牙齒，鼻咽部或者扁桃體的各種慢性炎症。
慢性咽炎還可以採用中醫中藥的方法進行治療，中醫認為慢性咽炎是陰虛火旺，虛火上擾所致的問題，治療上可以滋陰生津，清熱潤肺，常用的藥物有玄麥甘桔顆粒、養陰清肺口服液。慢性咽炎還可以用金嗓子喉寶，西瓜霜含片含服。復方硼砂溶液、呋喃西林溶液漱口以改善症狀。
慢性鼻炎的治療主要是分為四種方式：
1.鼻用糖皮質激素的應用：可以改善鼻塞減輕症狀，常用的藥物有糠酸莫米松、布地奈德鼻噴劑；
2.鼻減充血劑的應用：比較常用的有鹽酸羥甲唑啉和0.5-1%的麻黃素滴鼻液，可以明顯的改善鼻塞減輕症狀，但是由於這類藥物具有一定的粘膜毒性，必須嚴格限制其療程不能超過7天。可以間歇性用藥；
3.鼻腔沖洗：可以用溫熱的生理鹽水沖洗鼻腔，對於鼻腔分泌物比較粘稠的時候，可以明顯的減輕鼻塞改善症狀；
4.手術治療：對於藥物治療效果不好的慢性肥厚性鼻炎可以採取手術治療，主要是採用下鼻甲低溫等離子射頻手術。
