青霉素的療程主要看治療的目的，如果是外科預防用藥，一般不超過24小時。如果是抗感染治療，規範的治療是要先採取咽部或者其他病變部位的分泌物等進行細菌培養。
在輕症的感染時候，療程至少3天，三天以後如果臨床症狀明顯好轉，可以考慮換用口服藥物續貫治療。
如果臨床感染症狀比較重，三天以後根據細菌培養結果，考慮是否需要換用其它敏感的抗生素。
如果培養的細菌對青霉素是敏感的，可以繼續治療，根據病情決定進一步的療程，通常一般的細菌感染療程在一周左右。
嚴重的細菌感染，比如肺炎需要2-3周。臨床上可以根據體溫正常三天，身體陽性症狀比如肺部羅音消失三天以上，考慮停用靜脈用藥，改為口服藥物續貫治療。
