並不存在治療牙周疼痛最好的藥，常見的有甲硝唑片、布洛芬緩釋膠囊、阿莫西林膠囊、人工牛黃甲硝唑膠囊、丁硼乳膏等。這些藥物都有各自的特點和適用情況，具體使用哪種藥物需要根據個人的病情和身體狀況來決定，且都需要嚴格遵醫囑用藥。
1. 甲硝唑片：是一種常用的抗厭氧菌藥物，對於牙周炎等因厭氧菌感染引發的疼痛有較好療效。使用時需注意，對甲硝唑或其他硝基咪唑類藥物過敏者禁用。有活動性中樞神經系統疾病和血液病患者禁用。用藥期間及停藥後至少3天內，禁止飲酒和含有酒精的飲料。
2. 布洛芬緩釋膠囊：屬於非甾體抗炎藥，主要作用是緩解輕至中度疼痛，通過抑制前列腺素的合成來達到止痛效果。孕婦及哺乳期婦女禁用，對阿司匹林等非甾體抗炎藥過敏者禁用。不宜大量或長期服用，以免引起肝腎功能損害。
3. 阿莫西林膠囊：是一種廣譜抗生素，可抑制細菌細胞壁的合成，從而達到殺菌作用，常用於牙周炎症伴有細菌感染的情況。對青霉素過敏者禁用，用藥前需進行青霉素皮試。有哮喘、枯草熱等過敏性疾病史者慎用。
4. 人工牛黃甲硝唑膠囊：結合了人工牛黃和甲硝唑的成分，具有清熱解毒、抗菌消炎的作用，常用於急性智齒冠周炎、局部牙槽膿腫等引起的疼痛。對甲硝唑或吡咯類過敏患者禁用，有活動性中樞神經疾病和血液病患者禁用，孕婦禁用，飲酒者禁用。
5. 丁硼乳膏：作為一種口腔局部用藥，有消炎止痛作用，可用於急慢性牙齦炎、口腔炎等引起的牙痛、牙齦出血等症狀。壞死性牙齦炎或急性牙齦炎患者不宜採用刷牙方法，可將乳膏塗擦患處。對硼砂、丁香油及丁香酚過敏者禁用。
在使用藥物治療牙周疼痛時，除了嚴格遵醫囑用藥外，還應注意保持口腔清潔，養成良好的刷牙和漱口習慣。避免食用辛辣、刺激性食物，以免加重疼痛症狀。若用藥後症狀無明顯改善或出現其他不適，應及時就醫。
