基孔肯雅熱通常可依據不同症狀表現進行中醫辨證論治。
基孔肯雅熱在中醫範疇內可歸為疫疹痹證等範疇。中醫通過對患者整體狀態的觀察，包括症狀、體徵、舌象、脈象等綜合信息來判斷病情。對於發熱明顯、伴有頭痛、肌肉關節疼痛等症狀，多從清熱解表、通絡止痛等方向論治。利用中藥的特性，調節人體陰陽平衡，祛除病邪。
當出現高熱、口渴、面紅目赤等表現時，常採用清熱解毒之法，選用具有清熱功效的中藥，以清除體內熱毒，緩解高熱症狀。若以關節肌肉疼痛為主，且疼痛部位固定、屈伸不利，則注重祛風除濕、活血通絡，改善關節活動受限等情況。
在治療過程中，還會根據病情的發展和變化適時調整用藥。同時，中醫也重視整體調養。日常應注意休息，保證充足睡眠，使身體得到恢復。飲食上，避免食用辛辣、油膩、刺激性食物，以防加重體內濕熱之象。可適當食用清淡、易消化且營養豐富的食物，增強身體抵抗力。要注意皮膚清潔，避免搔抓，防止皮膚破損引發感染。需嚴格按照醫生的囑咐按時服藥，定期復診，以便醫生及時瞭解病情變化，調整治療方案。
