基孔肯雅熱的治療方法主要有一般治療、對症治療、抗病毒治療、中醫中藥治療、康復治療等。
1. 一般治療：基孔肯雅熱患者需臥床休息，保證充足睡眠，有助於身體恢復體力對抗病毒。同時要補充足夠水分，維持身體正常代謝，還應攝入富含營養且易消化的食物，像新鮮蔬果、瘦肉粥等，為身體提供能量和營養物質，增強免疫力以促進病情好轉。
2. 對症治療：針對基孔肯雅熱引發的高熱，可採用物理降溫，如用濕毛巾敷額頭等。若疼痛明顯，遵醫囑使用布洛芬膠囊、對乙酰氨基酚片、雙氯芬酸鈉緩釋片緩解疼痛。對於關節腫脹，可適當抬高患肢，促進血液回流，減輕腫脹程度，緩解不適症狀。
3. 抗病毒治療：在基孔肯雅熱發病早期，遵醫囑使用利巴韋林顆粒、阿昔洛韋片、更昔洛韋膠囊等抗病毒藥物，這些藥物能抑制病毒複製，減少病毒在體內的數量，從而減輕病毒對身體細胞的損傷，控制病情發展，縮短病程。
4. 中醫中藥治療：中醫通過辨證論治為基孔肯雅熱患者開具藥方，一些清熱解毒、祛濕通絡的中藥方劑可能有效。同時，還可配合針灸、推拿等中醫外治療法，刺激穴位，促進氣血運行，改善關節疼痛、肌肉酸痛等症狀，提高身體的整體狀態。
5. 康復治療：對於基孔肯雅熱病情緩解後仍有關節功能障礙的患者，可進行康復治療。通過專業的康復訓練，如關節活動度訓練、肌肉力量訓練等，幫助恢復關節功能，提高患者生活自理能力，盡可能減少疾病對身體功能的長期影響。
基孔肯雅熱患者在治療期間要保持良好心態，積極配合治療。居住環境應保持清潔、通風良好，避免交叉感染。飲食上繼續保持營養均衡，避免食用辛辣、油膩等刺激性食物。按醫囑定期復查，以便及時瞭解病情恢復情況，調整治療方案。
