無痛腸鏡常見副作用有麻醉相關反應、腸道穿孔、感染、出血、腸道氣體積聚等。
1. 麻醉相關反應：無痛腸鏡需使用麻醉藥物，部分人可能出現麻醉後頭暈、乏力、惡心、嘔吐等症狀，因為麻醉藥物在體內代謝需要一定時間，影響神經系統和胃腸道功能，一般休息一段時間、待藥物代謝後症狀會逐漸緩解。
2. 腸道穿孔：操作過程中，腸鏡可能因意外導致腸道穿孔，這是較為嚴重的併發症，會引起劇烈腹痛、腹膜炎等症狀，一旦發生通常需要緊急手術治療來修復穿孔部位。
3. 感染：腸道本身存在細菌，腸鏡檢查可能導致細菌移位進入血液或腹腔，引發感染，出現發熱、腹痛等症狀，嚴重程度不一，需根據情況使用抗生素治療。
4. 出血：腸鏡檢查時可能損傷腸道黏膜導致出血，少量出血大多可自行止血，若出血較多則可能需要採取內鏡下止血措施，甚至輸血治療。
5. 腸道氣體積聚：檢查中會向腸道內注入氣體以利於觀察，檢查後部分人腸道氣體積聚，引起腹脹、腹痛，一般通過適當活動、排氣後症狀可減輕。
做完無痛腸鏡後要注意休息，短時間內避免劇烈運動。飲食上，初期選擇清淡易消化食物，避免食用辛辣、油膩、刺激性食物。若出現腹痛加劇、發熱、便血等異常情況，應及時就醫，遵循醫生的後續診療建議，確保身體盡快恢復。
