自身免疫病和免疫缺陷病在發病原因、症狀表現、疾病類型、診斷方式、治療方法等方面上存在不同。
1. 發病原因：自身免疫病是免疫系統錯誤地攻擊自身組織和器官，將自身物質當作外來抗原，可能由遺傳、環境、感染等多種因素誘發；免疫缺陷病則是免疫系統發育不全或遭受損害，導致免疫功能低下或缺失，有先天性遺傳因素，也有後天如感染、藥物等因素引起。
2. 症狀表現：自身免疫病症狀多樣，累及不同器官系統，如類風濕關節炎有關節疼痛、腫脹、畸形；系統性紅斑狼瘡有面部紅斑、關節痛、腎臟損害等。免疫缺陷病主要表現為反復、嚴重的感染，對病原體抵抗力弱，易患各種感染性疾病。
3. 疾病類型：自身免疫病包括器官特異性和非器官特異性，如自身免疫性甲狀腺炎是器官特異性，系統性紅斑狼瘡是非器官特異性。免疫缺陷病分原發性和繼發性，原發性多由遺傳因素導致，繼發性常因後天因素引發。
4. 診斷方式：自身免疫病依靠臨床症狀、體徵，結合自身抗體檢測、組織病理檢查等診斷。免疫缺陷病診斷需評估免疫功能，如淋巴細胞計數、免疫球蛋白測定，還可能借助基因檢測明確病因。
5. 治療方法：自身免疫病治療旨在抑制異常免疫反應，常用藥物有糖皮質激素、免疫抑制劑等。免疫缺陷病治療根據病因，先天性可能需免疫重建，如造血乾細胞移植；繼發性要去除誘因，同時進行抗感染、免疫調節治療。
日常需保持健康的生活方式，規律作息、均衡飲食、適度運動，增強機體免疫力。自身免疫病和免疫缺陷病患者都應嚴格遵醫囑治療，定期復查，以便及時調整治療方案，控制病情發展。
