嚴重的甲溝炎的治療方法包括藥物治療、物理治療、切開引流、拔甲治療、甲溝重建術等。
1. 藥物治療：對於嚴重的甲溝炎，藥物治療可起到抗菌消炎的作用。常用的藥物有莫匹羅星軟膏、夫西地酸乳膏、復方多粘菌素B軟膏，需遵醫囑用藥。莫匹羅星軟膏對需氧革蘭陽性球菌有很強的抗菌活性，能有效抑制甲溝炎處的細菌繁殖。夫西地酸乳膏通過抑制細菌蛋白質的合成來發揮抗菌作用，可減輕甲溝部位的炎症。復方多粘菌素B軟膏含有多種抗生素成分，能增強抗菌效果，緩解甲溝炎引發的紅腫疼痛等症狀。
2. 物理治療：物理治療能促進局部血液循環，減輕炎症反應。常見的如熱敷，用溫熱的毛巾或熱水袋敷在患側甲溝部位，每次15 - 20分鐘，每天3 - 4次。紅外線照射也是一種方法，利用紅外線的熱效應，改善甲溝處的血液循環，增強局部組織的代謝和修復能力，有助於減輕腫脹和疼痛，促進炎症的消退。超短波治療同樣有效，它能使局部組織溫度升高，血管擴張，加速炎症滲出物的吸收，從而緩解嚴重甲溝炎的症狀。
3. 切開引流：當甲溝炎發展嚴重，局部形成膿腫時，切開引流是必要的手段。因為膿腫內積聚了大量的膿性分泌物，這些分泌物會持續刺激甲溝組織，加重炎症。通過在甲溝膿腫波動最明顯處切開，將膿液排出，能有效減輕局部壓力，緩解疼痛，同時減少細菌滋生的環境，防止炎症進一步擴散，促進甲溝組織的恢復。
4. 拔甲治療：若甲溝炎病情嚴重，指甲與甲溝組織粘連緊密且炎症廣泛，拔甲治療可有效去除病灶。指甲的存在會阻礙藥物的滲透和炎症的恢復，拔除指甲後，甲溝部位能夠充分暴露，便於進行清潔和上藥，有利於炎症的消退。同時，新的指甲會在合適的條件下重新生長，從而解決甲溝炎問題。
5. 甲溝重建術：對於一些慢性、復發性的嚴重甲溝炎，甲溝重建術是一種較為徹底的治療方法。由於長期的炎症刺激，甲溝的結構可能已經遭到破壞，單純的保守治療難以根治。甲溝重建術通過對甲溝的結構進行重新塑造和修復，去除病變組織，改善甲溝的生理結構，使其恢復正常的形態和功能，從而從根本上解決甲溝炎反復發作的問題。
在治療嚴重甲溝炎後，日常生活中要注意保持甲溝部位的清潔乾燥，避免穿過緊的鞋子，修剪指甲時不宜過短，防止損傷甲溝組織。同時，要嚴格按照醫生的囑咐進行後續護理和用藥，定期復查，以便及時發現問題並進行處理，促進病情的徹底康復。
