流行性乙型腦炎的治療方法主要有一般治療、對症治療、抗病毒治療、中醫治療、康復治療等。
1. 一般治療：對於流行性乙型腦炎患者，需安置在安靜、涼爽、有防蚊設施的病房，密切監測生命體徵，包括體溫、呼吸、心率、血壓等，以便及時發現病情變化。同時，要保證患者營養及能量供給，通過鼻飼或靜脈途徑補充足夠的蛋白質、維生素、電解質等，維持水、電解質及酸鹼平衡。做好口腔護理、皮膚護理，防止壓瘡和肺部感染等併發症的發生，為患者創造良好的恢復環境，利於身體機能的恢復。
2. 對症治療：針對流行性乙型腦炎引發的高熱，可採用物理降溫與藥物降溫相結合的方式，如冰敷額頭、腋窩、腹股溝等大血管豐富處，遵醫囑使用對乙酰氨基酚片、布洛芬膠囊、柴胡注射液等。對於驚厥或抽搐，需保持呼吸道通暢，防止窒息，遵醫囑使用地西泮注射液、苯巴比妥鈉注射液、水合氯醛灌腸劑等控制驚厥。呼吸衰竭是乙腦嚴重的症狀，必要時可使用呼吸興奮劑，如洛貝林注射液、尼可剎米注射液等，改善呼吸功能。
3. 抗病毒治療：在流行性乙型腦炎發病初期，抗病毒治療有助於抑制病毒複製，減輕病情。常用藥物如利巴韋林注射液，可通過抑制病毒的核酸合成發揮抗病毒作用；阿昔洛韋片，對皰疹病毒等有較好的抑制效果；更昔洛韋膠囊，能特異性抑制病毒DNA多聚酶，遵醫囑使用這些藥物可在一定程度上控制病毒在體內的繁殖，緩解症狀，促進患者康復。
4. 中醫治療：中醫可通過辨證論治為流行性乙型腦炎患者提供有效治療。對於邪犯衛氣證，常用銀翹散合白虎湯加減，以清熱解毒、辛涼透表；對於氣營兩燔證，清瘟敗毒飲加減可起到清氣涼營、瀉火解毒的功效；對於內閉外脫證，可使用安宮牛黃丸、紫雪丹等開竅醒神、回陽固脫。還可配合針灸治療，選取大椎、曲池、合谷等穴位，以調節人體氣血、臟腑功能，輔助身體恢復。
5. 康復治療：對於病情穩定但遺留有神經精神症狀的流行性乙型腦炎患者，康復治療至關重要。包括物理治療，如按摩、推拿、熱敷等，可促進血液循環，防止肌肉萎縮；運動療法，指導患者進行肢體的主動和被動運動，提高肢體運動能力；認知和語言訓練，針對有認知障礙和語言功能受損的患者，通過專業的訓練方法幫助其恢復。同時，心理康復也不容忽視，給予患者心理支持和疏導，幫助其樹立康復信心。
在治療流行性乙型腦炎後，患者要注意休息，保證充足睡眠，利於身體恢復。飲食上，應選擇清淡、易消化且營養豐富的食物，增強身體抵抗力。居住環境要保持清潔、通風良好，避免蚊蟲叮咬。按照醫生的囑咐定期復查，以便及時瞭解身體恢復情況，若出現異常症狀應及時就醫。
