肛瘻術後一般不會導致肛門失禁，但在某些特殊情況下可能出現。肛瘻手術是否引發肛門失禁取決於多種因素。若手術未損傷肛門括約肌等關鍵結構，通常不會影響肛門正常功能；若手術中對括約肌造成嚴重損傷，就可能導致不同程度的肛門失禁。
肛瘻手術旨在處理肛瘻病變，恢復肛門直腸周圍的健康。手術方式多樣，不同方式對肛門功能影響有別。簡單肛瘻手術操作相對簡單，對括約肌影響小，發生肛門失禁概率低；複雜肛瘻手術因涉及範圍廣、深度深，手術難度大，損傷括約肌風險增加，進而提高了肛門失禁的可能性。
肛門失禁程度也有所不同，輕微的可能只是對氣體控制稍差，嚴重的則可能完全無法控制排便。術後肛門功能的恢復情況還與患者自身身體狀況、術後護理等有關。年輕、身體素質好且術後護理得當的患者，肛門功能恢復往往較好；而年老體弱、有基礎疾病且護理不佳的患者，恢復相對困難，肛門失禁風險也會相應增加。
肛瘻術後要重視護理。保持傷口清潔，按要求進行坐浴，促進局部血液循環，利於傷口愈合。飲食上，避免食用辛辣、油膩等刺激性食物，多吃富含膳食纖維的食物，保持大便通暢，防止便秘或腹瀉對肛門造成不良影響。同時，要遵循醫生的康復指導，定期復查，以便及時發現並處理可能出現的問題。
