電子肛門鏡與腸鏡在檢查部位、設備特點、檢查目的、檢查準備、檢查體驗等方面存在區別 。
1. 檢查部位：電子肛門鏡主要用於檢查肛管及直腸下端，通常能觀察到距肛門緣約10 - 15釐米的範圍；腸鏡則可對整個結腸以及部分末端回腸進行檢查，能深入到距肛門100釐米以上的腸道部位。
2. 設備特點：電子肛門鏡相對較短、較粗，鏡頭直接觀察肛門及直腸下段；腸鏡細長且柔軟，帶有可彎曲的操作部，能在腸道內靈活轉彎，通過顯示屏清晰呈現腸道內部情況。
3. 檢查目的：電子肛門鏡主要用於診斷內痔、外痔、混合痔、肛裂、肛瘻、直腸息肉、直腸炎等肛門直腸疾病；腸鏡除了能發現直腸疾病外，還可用於診斷結腸息肉、結腸癌、潰瘍性結腸炎、克羅恩病等結腸和回腸末端疾病。
4. 檢查準備：電子肛門鏡檢查前一般只需排空大便即可；腸鏡檢查前需進行嚴格的腸道準備，通常要提前1 - 2天控制飲食，並服用瀉藥清潔腸道，以確保檢查時視野清晰。
5. 檢查體驗：電子肛門鏡檢查時間較短，一般幾分鐘即可完成，檢查時可能會有輕微的異物感和墜脹感；腸鏡檢查時間相對較長，可能需要15 - 30分鐘甚至更久，檢查過程中可能會有腹脹、腹痛等不適感覺。
日常要注意保持良好的生活習慣，規律飲食，多吃富含膳食纖維的食物，避免久坐、久站，適當運動，保持大便通暢。若出現便血、腹痛、腹瀉、便秘等腸道或肛門不適症狀，應及時就醫，在醫生的指導下選擇合適的檢查方法，以便早發現問題並進行治療 。
