硝呋太爾和甲硝唑在適用範圍、作用機制、不良反應、禁忌人群、用藥注意事項方面存在區別。
1. 適用範圍：硝呋太爾對多種病原體如細菌、滴蟲、念珠菌等引起的陰道炎有較好療效，還可用於泌尿系統感染；甲硝唑主要用於治療或預防厭氧菌引起的系統或局部感染，對滴蟲性陰道炎、細菌性陰道病效果顯著 。
2. 作用機制：硝呋太爾通過干擾病原體的代謝過程，抑制其生長繁殖；甲硝唑能進入厭氧菌細胞內，使細胞DNA螺旋結構斷裂或阻止其合成，促使細菌死亡 。
3. 不良反應：硝呋太爾不良反應相對較少，可能有輕度胃腸道反應如惡心、嘔吐等；甲硝唑不良反應較多，常見胃腸道反應如惡心、嘔吐、食慾不振等，還可能有神經系統症狀如頭痛、眩暈等 。
4. 禁忌人群：硝呋太爾對硝呋太爾過敏者禁用；甲硝唑對甲硝唑或其他硝基咪唑類過敏者禁用，孕婦及哺乳期婦女在特定階段需謹慎使用 。
5. 用藥注意事項：使用硝呋太爾期間一般無需特殊注意飲食；使用甲硝唑期間及停藥後一段時間內禁止飲酒，因可能引發雙硫侖樣反應 。
在使用這兩種藥物時，都應嚴格遵循醫生的指導，不可自行增減劑量或停藥，若出現不適及時就醫 。
