百日咳需與多種疾病進行鑒別診斷，如肺炎支原體肺炎、腺病毒肺炎、副百日咳桿菌肺炎、氣管異物、肺結核等。
1.肺炎支原體肺炎：多有發熱、咳嗽，肺部體徵不明顯，X 線檢查可見肺部多種形態的浸潤影，血清學檢查支原體抗體陽性可確診。
2.腺病毒肺炎：急起高熱，咳嗽較劇烈，可出現喘憋，肺部體徵出現較晚，X 線檢查可見大小不等片狀陰影。
3.副百日咳桿菌肺炎：症狀與百日咳相似，但病情較輕，痙咳不典型，病原學檢查可鑒別。
4.氣管異物：有異物吸入史，突然出現嗆咳，胸部 X 線或支氣管鏡檢查可發現異物。
5.肺結核：常有低熱、盜汗、乏力等全身症狀，咳嗽持續時間較長，痰中可找到結核菌，X 線檢查有助於診斷。
在日常生活中，要注意保持室內空氣流通，避免帶孩子去人員密集的場所。如果孩子出現咳嗽等症狀，應及時就醫，明確診斷，以便進行針對性的治療。
