寶寶蛋白質消化不良可出現腹脹、腹瀉、食慾不振、大便氣味比較臭、大便中存在沒有消化的成分等症狀，如果平時經常出現這種現象也會影響其他營養物質的吸收，降低身體抗病能力，導致生長髮育受到影響。因此一旦出現這種情況要及時採用正確的方式進行治療，而寶寶蛋白質消化不良可以通過以下方法治療：
1.調整飲食結構。一旦寶寶出現蛋白質消化不良現象，就應該少吃或者不吃雞蛋、魚肉、瘦肉等含蛋白質的食品。並且應該以清淡的食品為主，可以增加青菜和水果、粗糧等食品的攝入量，多喝水或者多喝些水果汁，能提高脾胃功能，從而加快消化不良的好轉速度。
2.一日三餐按時吃。如果寶寶飲食沒有規律也會導致腸胃功能紊亂，更容易出現蛋白質消化不良問題。因此一定要給寶寶養成良好的飲食習慣，一日三餐應該按時吃。而患病期間最好採取少量多次的方式進餐，千萬不能暴飲暴食，以免增加消化系統的負擔而導致症狀加重。
3.遵照醫囑用藥治療。如果寶寶蛋白質消化不良症狀比較嚴重了，就應該遵照醫囑採用針對性的藥物治療，比如使用健脾益胃的中藥調理脾胃功能，就可以很快得到明顯的治療效果。也可以遵照醫囑服用益生菌類藥品，這類藥品的安全性也比較高，同樣也能幫寶寶提高脾胃功能。使用藥物治療期間還可以經常給寶寶按揉腹部，腹部有很多穴位受到刺激，可以提高脾胃功能，從而起到防治消化不良的作用。
上述這些都是臨床中常用的防治寶寶蛋白質消化不良的方法，而家長朋友們最好遵照醫囑給寶寶採取綜合全面的方法進行防治，才能提高治療效果。要注意的是，剛添加輔食的寶寶的腸胃功能比較弱，不能吃太多含蛋白質的食品，也不能一次添加多種輔食，以減少蛋白質消化不良的發生率。
